Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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CHD4Q14839 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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CHD4Q14839 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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CHD4Q14839 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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CHD4Q14839 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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CHD4Q14839 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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CHD4Q14839 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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