Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms