Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 ZNF611-214ENST00000600943 560 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AQP4-208ENST00000622234 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 ROBO1-204ENST00000467549 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 LGI1-211ENST00000630047 1751 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 CPNE8-201ENST00000331366 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 CPA4-202ENST00000445470 2718 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 GTF2A1-203ENST00000553612 6306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 CHRDL1-201ENST00000372042 1934 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RASSF6-203ENST00000342081 4331 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 FSD1L-202ENST00000374710 7664 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 CRNKL1-201ENST00000377327 4370 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 MIER1-201ENST00000355356 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 SEPT4-216ENST00000580844 1396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 PDCD6IP-201ENST00000307296 6161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 MIPOL1-211ENST00000556451 2282 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 ELK3-201ENST00000228741 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 CYP4A11-204ENST00000462347 1775 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 MYT1L-202ENST00000399161 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 SERPINA9-203ENST00000380365 1333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 LMO7-218ENST00000526202 4121 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RNASEH2B-AS1-209ENST00000631080 1707 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 ABI1-209ENST00000376166 3441 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 U3.33-201ENST00000408117 204 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 MIR1184-2-201ENST00000408263 99 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
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MKRN4PQ13434 MIR1184-3-201ENST00000408676 99 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RPL7L1P12-201ENST00000417594 729 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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MKRN4PQ13434 AL773572.1-202ENST00000440221 1004 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AL391825.1-202ENST00000458136 741 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AL590326.1-201ENST00000460857 334 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
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MKRN4PQ13434 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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MKRN4PQ13434 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC009997.1-201ENST00000557862 129 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC091180.5-201ENST00000576461 382 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC012447.1-201ENST00000577914 682 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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MKRN4PQ13434 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
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MKRN4PQ13434 AC017000.1-201ENST00000639380 578 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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MKRN4PQ13434 LIG4-202ENST00000405925 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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MKRN4PQ13434 NUDT13-201ENST00000349051 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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MKRN4PQ13434 PCDH19-201ENST00000255531 7937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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MKRN4PQ13434 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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MKRN4PQ13434 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 GINS1-201ENST00000262460 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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MKRN4PQ13434 ZBTB40-204ENST00000404138 8992 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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MKRN4PQ13434 DLEU1-212ENST00000469754 2955 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 CPSF4L-201ENST00000344935 647 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 SMIM7-201ENST00000358726 850 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RN7SKP37-201ENST00000364494 296 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AL136981.1-201ENST00000411450 549 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC008063.1-201ENST00000418335 640 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AL050320.1-201ENST00000420044 446 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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