Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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PGGT1BP53609 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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PGGT1BP53609 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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PGGT1BP53609 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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PGGT1BP53609 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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