Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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HOXD12P35452 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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HOXD12P35452 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD12P35452 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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