Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 IGFN1-202ENST00000335211 11810 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 MCPH1-201ENST00000344683 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ATP2B2-203ENST00000383800 8900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 VWA5A-205ENST00000456829 4388 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 MRPS23-201ENST00000313608 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 CC2D2A-204ENST00000503292 5175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 TRPM3-204ENST00000360823 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 COL4A6-201ENST00000334504 6700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 LRRC37A6P-202ENST00000448648 5444 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 FN1-209ENST00000432072 7759 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 MTHFR-203ENST00000376585 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 PAPPA2-202ENST00000367662 9691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 GRIK2-207ENST00000421544 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 KIF13A-203ENST00000378814 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 PDK1-201ENST00000282077 14193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 CDH7-202ENST00000397968 12231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms