Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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