Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 LINC00578-202ENST00000442937 612 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 SNORA35.1-201ENST00000458908 128 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC007547.2-201ENST00000468802 360 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 IGKV1D-16-201ENST00000492446 378 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 KCNMA1-AS1-204ENST00000595702 504 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 CLEC19A-205ENST00000636231 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 HNRNPU-219ENST00000639628 4546 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 SVEP1-202ENST00000374469 12194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 HMSD-201ENST00000408945 2101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 SLC24A1-211ENST00000544319 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 PPP2R2B-211ENST00000508545 2042 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ERC1-202ENST00000355446 5796 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 NPEPPS-215ENST00000530173 2864 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 SZT2-210ENST00000634258 11045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 NF1P1-201ENST00000604105 2645 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 R3HCC1L-203ENST00000370584 3372 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 NSRP1-217ENST00000612959 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 CYP27C1-201ENST00000335247 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 KCNK2-201ENST00000391894 1491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 MAGEC1-201ENST00000285879 4270 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 PGR-202ENST00000325455 13748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ERCC4-201ENST00000311895 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 PSG8-203ENST00000404209 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 DHFR2-202ENST00000394221 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 SETD7-207ENST00000608958 5281 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL158206.1-201ENST00000563205 1965 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 MTMR8-201ENST00000374852 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 FAM120B-203ENST00000537664 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RN7SKP211-201ENST00000363328 315 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL353151.1-201ENST00000402406 604 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL451074.1-202ENST00000453762 989 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 WBP1LP1-201ENST00000460451 896 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RN7SL36P-201ENST00000469345 276 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL049780.1-201ENST00000554430 489 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 OR4N1P-201ENST00000554847 949 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC023813.3-201ENST00000561876 539 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 DNM1P31-201ENST00000564149 696 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC008770.1-209ENST00000591898 356 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 XPNPEP3-206ENST00000614001 230 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 UQCRC2-213ENST00000630839 535 ntTSL 4 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 LINC00466-206ENST00000634576 1279 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 LRRC37A11P-202ENST00000579258 3717 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 CEACAM7-201ENST00000006724 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 FHL1-206ENST00000394153 2374 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ZC3H6-202ENST00000409871 11542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
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