Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms