Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms