Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
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ECM1Q16610 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
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ECM1Q16610 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
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ECM1Q16610 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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ECM1Q16610 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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ECM1Q16610 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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ECM1Q16610 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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ECM1Q16610 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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