Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AMD1-201ENST00000368876 3040 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 TOMM7-202ENST00000372879 514 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC012451.1-201ENST00000412312 357 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 CLIC4P3-201ENST00000422221 752 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC009362.1-201ENST00000427253 406 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LINC01961-201ENST00000449954 745 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RPL34P29-201ENST00000491411 325 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 OR4C1P-201ENST00000530880 937 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC025252.2-201ENST00000537470 502 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 MIR5705-201ENST00000579870 89 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms