Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 TRIM66-201ENST00000299550 9753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 KIAA1671-201ENST00000358431 10490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MAST4-204ENST00000405643 7713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ACP6-205ENST00000583509 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SLC16A1-AS1-204ENST00000428411 8757 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AURKA-208ENST00000395915 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 BDP1-201ENST00000358731 11073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 DMBT1-203ENST00000344338 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 DMBT1-205ENST00000368955 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MUC6-201ENST00000421673 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 HDGFL3-201ENST00000299633 12733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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