Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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SS18Q15532 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SS18Q15532 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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SS18Q15532 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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SS18Q15532 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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SS18Q15532 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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SS18Q15532 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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