Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
R3HDM1Q15032 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144 ms