Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FHL3Q13643 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189 ms