Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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TOP3AQ13472 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
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TOP3AQ13472 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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TOP3AQ13472 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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TOP3AQ13472 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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TOP3AQ13472 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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TOP3AQ13472 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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TOP3AQ13472 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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TOP3AQ13472 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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TOP3AQ13472 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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TOP3AQ13472 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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TOP3AQ13472 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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