Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 CDH18-201ENST00000274170 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AL357556.1-201ENST00000421884 1388 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 STAG3-219ENST00000620100 4203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 FAM107A-201ENST00000360997 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 MFSD8-207ENST00000513559 1813 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 OR6N1-203ENST00000641846 2640 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AL138756.1-201ENST00000563434 4488 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 MRPL22-206ENST00000522038 3162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 C7orf73-202ENST00000507606 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 TEX11-203ENST00000374333 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 MTIF2-203ENST00000394600 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 SLC10A7-201ENST00000335472 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 ERG-206ENST00000398911 4914 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 TBC1D22A-AS1-202ENST00000640274 1951 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 LINC00927-203ENST00000558913 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 ATP5A1P10-201ENST00000622403 1603 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 ZNF780B-201ENST00000221355 3538 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RRN3-203ENST00000429751 2198 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 LIMA1-216ENST00000552909 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 GAD1-217ENST00000625689 3700 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 COLGALT2-203ENST00000367521 4723 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AL773545.1-201ENST00000425632 347 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AL445187.1-201ENST00000502685 260 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC107220.1-201ENST00000514347 1037 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RPL10P19-201ENST00000519013 301 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC006581.1-201ENST00000545706 496 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 LINC00663-206ENST00000589910 732 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 UTP23-201ENST00000309822 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 XRCC5-202ENST00000392133 3761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 EXOC6-204ENST00000443748 3310 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 NBPF19-203ENST00000578189 5034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 NHLRC3-203ENST00000470258 3298 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 SYNE1-217ENST00000466159 2610 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 TCF4-211ENST00000561992 2184 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 LINC02128-205ENST00000641755 1334 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 TNIK-201ENST00000284483 4059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 GJB7-203ENST00000525899 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RBFOX1-203ENST00000355637 3321 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 TREML2-201ENST00000483722 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 PTK2B-205ENST00000420218 3941 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 ZNF577-201ENST00000301399 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 ALG9-210ENST00000531154 1930 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms