Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MS4A2-204ENST00000617306 3512 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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