Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
DEFA6Q01524 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms