Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TTPAP49638 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TTPAP49638 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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TTPAP49638 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TTPAP49638 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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