Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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COPS7AQ9UBW8 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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COPS7AQ9UBW8 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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COPS7AQ9UBW8 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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COPS7AQ9UBW8 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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