Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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