Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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