Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms