Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
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TRAF1Q13077 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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TRAF1Q13077 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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TRAF1Q13077 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
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TRAF1Q13077 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
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TRAF1Q13077 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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TRAF1Q13077 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
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