Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 AC092421.1-201ENST00000448148 418 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 WBP1LP1-201ENST00000460451 896 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MCCD1P59942 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 GRIK2-207ENST00000421544 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 PWRN1-211ENST00000568609 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MCCD1P59942 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms