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| FXN | Q16595 | AC015724.1-201 | ENST00000478577 | 156 nt | BASIC | 6.34 | □□□□□ -1.39 | | |
| FXN | Q16595 | SUB1-203 | ENST00000502897 | 562 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 6.34 | □□□□□ -1.39 | | |
| FXN | Q16595 | SUB1-211 | ENST00000512913 | 684 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 6.34 | □□□□□ -1.39 | | |
| FXN | Q16595 | TBCA-206 | ENST00000518338 | 551 nt | TSL 2 BASIC | 6.34 | □□□□□ -1.39 | | |
| FXN | Q16595 | ELOC-204 | ENST00000519487 | 814 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 6.34 | □□□□□ -1.39 | | |
| FXN | Q16595 | TMEM68-206 | ENST00000519784 | 1009 nt | TSL 3 BASIC | 6.34 | □□□□□ -1.39 | | |
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| FXN | Q16595 | AFF2-203 | ENST00000370457 | 3952 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.34 | □□□□□ -1.39 | | |
| FXN | Q16595 | AGTR1-205 | ENST00000461609 | 1545 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 6.34 | □□□□□ -1.39 | | |
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| FXN | Q16595 | ZNF292-201 | ENST00000339907 | 8287 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 6.34 | □□□□□ -1.4 | | |
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| FXN | Q16595 | ZNF131-201 | ENST00000306938 | 2400 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 6.34 | □□□□□ -1.4 | | |
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| FXN | Q16595 | LINC01252-201 | ENST00000499291 | 3673 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.34 | □□□□□ -1.4 | | |
| FXN | Q16595 | TLR6-205 | ENST00000610323 | 1443 nt | TSL 5 BASIC | 6.33 | □□□□□ -1.4 | | |
| FXN | Q16595 | RBPJP2-201 | ENST00000618187 | 1444 nt | BASIC | 6.33 | □□□□□ -1.4 | | |
| FXN | Q16595 | KRT39-201 | ENST00000355612 | 1696 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.33 | □□□□□ -1.4 | | |
| FXN | Q16595 | DEUP1-209 | ENST00000531792 | 1656 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.33 | □□□□□ -1.4 | | |
| FXN | Q16595 | CLCC1-205 | ENST00000369969 | 4343 nt | TSL 5 BASIC | 6.33 | □□□□□ -1.4 | | |
| FXN | Q16595 | NXF3-201 | ENST00000395065 | 1938 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.33 | □□□□□ -1.4 | | |
| FXN | Q16595 | SOX5-205 | ENST00000451604 | 4261 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.33 | □□□□□ -1.4 | | |
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| FXN | Q16595 | ZNF705D-201 | ENST00000400078 | 925 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 6.33 | □□□□□ -1.4 | | |
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| FXN | Q16595 | RNA5SP115-201 | ENST00000411160 | 107 nt | BASIC | 6.33 | □□□□□ -1.4 | | |
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| FXN | Q16595 | GLYCTK-AS1-203 | ENST00000493616 | 445 nt | TSL 3 BASIC | 6.33 | □□□□□ -1.4 | | |
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| FXN | Q16595 | MTCO2P32-201 | ENST00000514865 | 403 nt | BASIC | 6.33 | □□□□□ -1.4 | | |
| FXN | Q16595 | RN7SKP31-201 | ENST00000516354 | 278 nt | BASIC | 6.33 | □□□□□ -1.4 | | |
| FXN | Q16595 | RNA5SP135-201 | ENST00000517019 | 125 nt | BASIC | 6.33 | □□□□□ -1.4 | | |
| FXN | Q16595 | TPT1-AS1-207 | ENST00000520310 | 563 nt | TSL 5 BASIC | 6.33 | □□□□□ -1.4 | | |
| FXN | Q16595 | COX6B1P6-201 | ENST00000522347 | 255 nt | BASIC | 6.33 | □□□□□ -1.4 | | |
| FXN | Q16595 | SMARCE1P4-201 | ENST00000523647 | 241 nt | BASIC | 6.33 | □□□□□ -1.4 | | |
| FXN | Q16595 | AC118942.1-202 | ENST00000529081 | 578 nt | TSL 5 BASIC | 6.33 | □□□□□ -1.4 | | |
| FXN | Q16595 | LINC00301-204 | ENST00000532591 | 470 nt | TSL 2 BASIC | 6.33 | □□□□□ -1.4 | | |
| FXN | Q16595 | AC092851.1-201 | ENST00000535964 | 478 nt | BASIC | 6.33 | □□□□□ -1.4 | | |