Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC009117.3-201ENST00000568136 543 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 CR382285.1-202ENST00000604687 547 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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CCDC85BQ15834 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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CCDC85BQ15834 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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CCDC85BQ15834 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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CCDC85BQ15834 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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CCDC85BQ15834 RPL34P19-201ENST00000415903 342 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
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CCDC85BQ15834 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
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CCDC85BQ15834 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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CCDC85BQ15834 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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