Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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CHD4Q14839 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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CHD4Q14839 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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CHD4Q14839 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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