Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms