Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CNGB1Q14028 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms