Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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