Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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