Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
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CUL4AQ13619 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
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CUL4AQ13619 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
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CUL4AQ13619 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
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CUL4AQ13619 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
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CUL4AQ13619 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
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CUL4AQ13619 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
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CUL4AQ13619 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL4AQ13619 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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