Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms