Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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