Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DEFA6Q01524 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms