Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LTBRP36941 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
LTBRP36941 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LTBRP36941 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
LTBRP36941 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
LTBRP36941 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
LTBRP36941 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
LTBRP36941 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
LTBRP36941 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
LTBRP36941 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
LTBRP36941 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
LTBRP36941 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
LTBRP36941 SIPA1L1-203ENST00000537413 4129 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
LTBRP36941 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
LTBRP36941 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 FTH1P20-201ENST00000434913 548 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LTBRP36941 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LTBRP36941 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LTBRP36941 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
LTBRP36941 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms