Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SMG9Q9H0W8 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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