Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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