Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ABHD2-201ENST00000352732 8735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 PREX2-201ENST00000288368 10750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 TNC-210ENST00000535648 7508 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 TACC2-229ENST00000515603 9101 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ATG2B-202ENST00000359933 13684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SPATA13-206ENST00000424834 8603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC131649.2-201ENST00000624925 4439 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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HERC1Q15751 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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HERC1Q15751 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 PDE4DIP-219ENST00000524974 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 PHF3-201ENST00000262043 8233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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HERC1Q15751 CDC42BPA-205ENST00000366769 10855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ZNF264-201ENST00000263095 12163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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