Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CACNA1SQ13698 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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