Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SP140Q13342 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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