Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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