Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBRQ0VD83 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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