Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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