Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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ZNRF3Q9ULT6 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ZNRF3Q9ULT6 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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