Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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COPS7AQ9UBW8 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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COPS7AQ9UBW8 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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COPS7AQ9UBW8 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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COPS7AQ9UBW8 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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COPS7AQ9UBW8 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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COPS7AQ9UBW8 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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COPS7AQ9UBW8 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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COPS7AQ9UBW8 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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COPS7AQ9UBW8 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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