Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms